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A antiga Sé foi construída durante o séc. XVI por iniciativa camarária e com o apoio do duque D. Teodósio, sabendo-se que Pêro de la Faia e Fernão Pires foram os seus mestres-de-obras. Destinava-se inicialmente a ser um Convento da Ordem de Santa Clara, mas foi ocupado pela Companhia de Jesus entre 1562 e 1759, funcionando como Colégio. Em 1764, quando se transferiu a sede de bispado de Miranda para Bragança, a igreja passou a Sé Catedral, altura em que sofreu obras de ampliação.

De salientar o portal renascentista com elementos barrocos na fachada lateral norte. Ao centro, podemos ver um nicho com uma Virgem do Leite com o Menino. O interior é bastante decorado, destacando-se o arco triunfal com as armas da cidade, o altar-mor de talha dourada do séc. XVIII e os retábulos laterais, da mesma época.

Vale a pena visitar a sacristia do séc. XVII, onde encontramos um arcaz de grande qualidade ornamentado com pinturas a óleo representando cenas da vida de São Francisco de Assis e de Santo Inácio. No teto pintado repete-se o tema de Santo Inácio. O claustro renascentista, de dois pisos, mantém a sua estrutura original.