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Ubicado en un marco de excepcional belleza, la seo mirobrigense, este museo alberga importantes colecciones arqueológicas, entre las que destacan piezas prehistóricas de la comarca, algunos vestigios de su pasado romano (incluyendo piezas funerarias y numismáticas), pizarras visigóticas procedentes de Lerilla, con grabados y numeraciones, que fueron legadas a la Catedral, y restos arquitectónicos de las distintas fases constructivas de la misma.

Una segunda sala está dedicada a la liturgia, destacando un báculo del siglo XIII de la escuela de Limoges, una colección de cruces procesionales y el breviario de Isabel la Católica.

La tercera sala está dedicada a la escultura, con piezas como un Cristo de Marfil hispano-filipino de grandes dimensiones, una talla de Santa Catalina de Alejandría del siglo XVI y una serie de vírgenes sedentes que permite conocer la evolución de esta particular iconografía. Finalmente, la rica sección pictórica, en la que destacan obras como el Llanto sobre Abel muerto o un magnífico San Miguel de Antonio María Esquivel.

El museo se completa en el Pórtico del Perdón, con un audiovisual que se proyecta sobre la reproducción del antiguo retablo de la seo, pintado en el Renacimiento por Fernando Gallego. La visita incluye el acceso al Claustro y al Coro.