Mandada construir por D. João III, en el contexto de una reorganización político-religiosa del reino que también abarcó las catedrales de Portalegre y de Leiria, la Catedral de Miranda do Douro fue iniciada el 24 de mayo de 1552 y la consagración del altar data de 1586. La obra implicó la destrucción de la antigua Iglesia de Santa María, un templo gótico levantado durante el reinado de D. Dinis, en el siglo XIV. Proyecto de Gonçalo Torralva y Miguel de Arruda, con posterior ejecución de Francisco Velasquez, la construcción fue concluida a inicios del siglo XVII, manteniendo el estatuto de catedral episcopal hasta 1780, año en que la sede de la diócesis fue transferida para Bragança (con la designación de Diócesis de Bragança y Miranda). Este edificio pasó a ser designado como Concatedral o simplemente por Iglesia Matriz de Miranda do Douro.

La transferencia de la sede de la dioceses podrá estar ligada a la historia de Miranda do Douro que, por su condición de frontera, cayó por dos veces en poder español en el siglo XVIII. Bragança era una ciudad menos expuesta a las amenazas externas.

De concepción manierista, este notable templo posee una fachada armónica, en que un cuerpo central es ladeado por dos poderosas torres, con un interior en tres naves abovedadas estilo gótico y crucero de ojivas de nervios visibles. El retablo mayor, un conjunto escultural dedicado a Santa Maria Maior, es ya una obra del siglo 17 y se debe al trabajo de Gregório Fernández, maestro gallego radicado en Valladolid y responsable de un taller bastante activo durante el periodo manierista.

En la Catedra, existen otros retablos que merecen la atención del visitante, como el de San Bento, o de Nuestra Señora de los Remedios, el de las Reliquias, el de Santo Amaro o el retablo de Nuestra Señora del Rosario (actualmente del Sagrado Corazón de Jesús). En estilo barroco y datados del siglo XVIII, se pueden observar los retablos de San Pedro, de San Jerónimo y de Nuestra Señora de la Piedad. La silla del coro del Cabildo, obra de gran refinamiento y raridad, data del siglo XVII y es de estilo manierista.

La Seo Catedral de Miranda do Douro es también conocida por guardar un icono de la religiosidad popular – el Menino Jesus da Cartolinha. Se puede observar esta pequeña imagen del siglo 17 en un oratorio en talla dorada barroca, en donde los devotos depositan sus ofrendas.